San Diego County ist ein County im US-Bundesstaat Kalifornien.
Das County durchfließt der San Diego River. Das südliche Ende des Countys bildet bereits die Grenze zu Mexiko.
Die Wurzeln des Countys reichen zurück in die Zeit, in der die Misión San Diego de Alcalá 1769 dort gegründet wurde. San Diego County war eines der ersten Countys in Kalifornien. Es wurde 1850 bei der Staatsgründung geschaffen. Teile des Countys wurden später an das Riverside County 1893 und an das Imperial County 1907 abgegeben.
Der Countyname kommt von der San Diego Bay, einer Bucht, die Sebastián Vizcaíno 1602 nach dem franziskanischen Laien San Diego de Alcalá de Henares benannte, dessen Name auf dem Flaggschiff prangte.